ΒΙΟΠΛΗΡΟΦΟΡΙΚΗ II - ΨΗΦΙΑΚΗ ΒΙΟΛΟΓΙΑ

Πληροφορίες Μαθήματος
ΤίτλοςΒΙΟΠΛΗΡΟΦΟΡΙΚΗ II - ΨΗΦΙΑΚΗ ΒΙΟΛΟΓΙΑ / BIOINFORMATICS II - DIGITAL BIOLOGY
ΚωδικόςNNA-07-10
ΣχολήΘετικών Επιστημών
ΤμήμαΠληροφορικής
Κύκλος / Επίπεδο1ος / Προπτυχιακό
Περίοδος ΔιδασκαλίαςΧειμερινή
Υπεύθυνος/ηΧρήστος Ουζούνης
ΚοινόΌχι
ΚατάστασηΕνεργό
Course ID600020400

Πρόγραμμα Σπουδών: ΠΠΣ-Τμήμα Πληροφορικής (2019-σήμερα)

Εγγεγραμμένοι φοιτητές: 35
ΚατεύθυνσηΤύπος ΠαρακολούθησηςΕξάμηνοΈτοςECTS
ΓΕΝΙΚΗ ΚΑΤΕΥΘΥΝΣΗΕπιλογής745
Πληροφορίες Τάξης
ΤίτλοςΒΙΟΠΛΗΡΟΦΟΡΙΚΗ II - ΨΗΦΙΑΚΗ ΒΙΟΛΟΓΙΑ
Ακαδημαϊκό Έτος2022 – 2023
Περίοδος ΤάξηςΧειμερινή
Διδάσκοντες μέλη ΔΕΠ
Ώρες Εβδομαδιαία3
Ώρες Συνολικά39
Class ID
600219666
Τύπος Μαθήματος
Ειδικού Υποβάθρου
Τύπος Μαθήματος 2016-2020
  • Επιστημονικής Περιοχής
Τύπος Μαθήματος 2011-2015
Ειδικού Υποβάθρου / Κορμού
Τρόπος Παράδοσης
  • Πρόσωπο με πρόσωπο
  • Eξ απoστάσεως εκπαίδευση
Ηλεκτρονική Διάθεση Μαθήματος
Erasmus
Το μάθημα προσφέρεται και σε φοιτητές προγραμμάτων ανταλλαγής.
Γλώσσα Διδασκαλίας
  • Ελληνικά (Διδασκαλία, Εξέταση)
  • Αγγλικά (Διδασκαλία, Εξέταση)
Προαπαιτήσεις
Γενικές Προαπαιτήσεις
πληροφορική, προγραμματισμός
Μαθησιακά Αποτελέσματα
Γνώσεις: Κατάρτιση των φοιτητών σε γνώσεις βιολογίας συστημάτων. Τεχνολογίες παραγωγής δεδομένων επόμενης γενεάς. Πόροι και ολοκλήρωση δεδομένων, οπτικοποίηση. Μοντέλα αλληλεπιδράσεων, γραφήματα, στατικά και δυναμικά μοντέλα. Ακρίβεια και ποιοτικός έλεγχος. Αλγόριθμοι ανίχνευσης μοτίβων σε μεγάλα δεδομένα και συστήματα προσομοίωσης. Νοήμονα συστήματα αναπαράστασης βιολογικής πολυπλοκότητας. Συνθετική βιολογία, βιο-εμπνευσμένες τεχνολογίες και τεχνολογίες ζωής. Υπολογιστικές προκλήσεις και μελλοντικές προοπτικές. Δεξιότητες: Απόκτηση ικανότητας αναγνώρισης και επιλογής πόρων και εργαλείων για βιολογία συστημάτων. Επίλυση ερωτήσεων, επαναληψιμότητα, αναζήτηση βιβλιογραφικών και βιο-συστημικών πληροφοριών. Παρουσίαση εργασίας (ικανότητα επικοινωνίας, σωστή χρήση τεχνικών παρουσίασης, εξοικείωση με ερωτήσεις από το κοινό).
Γενικές Ικανότητες
  • Εφαρμογή της γνώσης στην πράξη
  • Αναζήτηση, ανάλυση και σύνθεση δεδομένων και πληροφοριών, με τη χρήση και των απαραίτητων τεχνολογιών
  • Λήψη αποφάσεων
  • Αυτόνομη εργασία
  • Ομαδική εργασία
  • Εργασία σε διεπιστημονικό περιβάλλον
  • Παραγωγή νέων ερευνητικών ιδεών
  • Σχεδιασμός και διαχείριση έργων
  • Άσκηση κριτικής και αυτοκριτικής
  • Προαγωγή της ελεύθερης, δημιουργικής και επαγωγικής σκέψης
Περιεχόμενο Μαθήματος
Θεωρία: Εισαγωγή στη βιολογία συστημάτων. Πρόσβαση σε δεδομένα μεγάλης κλίμακας, και τεχνολογιών επόμενης γενεάς. Ολοκλήρωση και οπτικοποίηση δεδομένων. Δημιουργία μοντέλων, μικρής κλίμακας/μεγάλης ακρίβειας και μεγάλης κλίμακας/μικρής ακρίβειας. Χρήση εργαλείων αναπαράστασης γνώσης με νοήμονα συστήματα. Βάσεις συνθετικής βιολογίας, χρήση βιο-εμπνευσμένων τεχνολογιών. Εφαρμογές στην ιατρική, περιβάλλον, και ψηφιακή βιολογία. Εργαστήριο: βάσεις δεδομένων, κατηγορίες εργαλείων. Επαναληψιμότητα, ποιοτικός έλεγχος και ανίχνευση προτύπων σε δεδομένα μεγάλης κλίμακας. Ασκήσεις προγραμματισμού, ολοκλήρωση δεδομένων και λογισμικού, data standards.
Λέξεις Κλειδιά
βιολογία συστημάτων, βιο-εμπνευσμένες τεχνολογίες, συνθετική βιολογία
Τύποι Εκπαιδευτικού Υλικού
  • Σημειώσεις
  • Διαφάνειες
  • Βιντεοδιαλέξεις
  • Βιβλίο
Χρήση Τεχνολογιών Πληροφορίας και Επικοινωνιών
Χρήση Τ.Π.Ε.
  • Χρήση Τ.Π.Ε. στη Διδασκαλία
  • Χρήση Τ.Π.Ε. στην Εργαστηριακή Εκπαίδευση
  • Χρήση Τ.Π.Ε. στην Επικοινωνία με τους φοιτητές
  • Χρήση Τ.Π.Ε. στην Αξιολόγηση των Φοιτητών
Περιγραφή
Το μάθημα είναι βασισμένο αποκλειστικά σε ΤΠΕ λόγω περιεχομένου.
Οργάνωση Μαθήματος
ΔραστηριότητεςΦόρτος ΕργασίαςECTSΑτομικάΟμαδικάErasmus
Διαλέξεις50
Εργαστηριακή Άσκηση20
Συγγραφή εργασίας / εργασιών25
Εξετάσεις
Άλλο / Άλλα5
Σύνολο100
Αξιολόγηση Φοιτητών
Περιγραφή
Περιγραφή Η αξιολόγηση του μαθήματος γίνεται με τους παρακάτω τρόπους: • Γραπτή εξέταση που συνεισφέρει το 40% του βαθμού του μαθήματος, • Εργαστηριακή άσκηση θα είναι το 30% του συνολικού βαθμού, • Προσομοίωση ερευνητικής εργασίας θα είναι το 30% του συνολικού βαθμού.
Μέθοδοι Αξιολόγησης Φοιτητών
  • Γραπτή Εξέταση με Ερωτήσεις Πολλαπλής Επιλογής (Διαμορφωτική)
  • Γραπτή Εξέταση με Ερωτήσεις Σύντομης Απάντησης (Διαμορφωτική)
  • Γραπτή Εξέταση με Ερωτήσεις Εκτεταμένης Απάντησης (Διαμορφωτική)
  • Γραπτή Εργασία (Διαμορφωτική)
  • Γραπτή Εξέταση με Επίλυση Προβλημάτων (Διαμορφωτική)
Βιβλιογραφία
Βιβλιογραφία μαθήματος (Εύδοξος)
Συνθετική Βιολογία : Βασικές Αρχές, by Geoff Baldwin et al. publisher: UTOPIA (2017) Language: Ελληνικά Paperback: 160 ISBN: 978-618-5173-26-5 Εύδοξος: 68403717 An Introduction to Systems Biology : Design Principles of Biological Circuits, by Uri Alon publisher: Chapman & Hall; 2nd edition (2019) Language: English Paperback: 324 pages ISBN-10: 1439837171 ISBN-13: 978-1439837177 https://www.weizmann.ac.il/mcb/UriAlon/introduction-systems-biology-design-principles- biological-circuits
Επιπρόσθετη βιβλιογραφία για μελέτη
Systems Biology: Introduction to Pathway Modeling, by Herbert M. Sauro publisher: Ambrosius Publishing & Future Skill Softrware; new edition 1.2 (2020) Language: English Paperback: 480 pages ISBN-13: 978-0982477373 Automated Reasoning for Systems Biology and Medicine, Pietro Liò & Paolo Zuliani (eds) publisher: Springer (2019) Language: English Paperback: 470 pages ISBN: 978-3-030-17299-2 eBook: EPUB, PDF ISBN: 978-3-030-17297-8 https://www.springer.com/gp/book/9783030172961 Bio-inspired artificial intelligence, by Dario Floreano & Claudio Mattiussi publisher: MIT Press (2008) Language: English Hardcover: 674 pages ISBN: 978-0262062718 https://mitpress.mit.edu/books/bio-inspired-artificial-intelligence
Τελευταία Επικαιροποίηση
29-03-2023