Βιολογία Συστημάτων
| Τίτλος | Βιολογία Συστημάτων / Systems biology |
| Κωδικός | ΒΜ01α |
| Σχολή | Πολυτεχνική |
| Τμήμα | Ηλεκτρολόγων Μηχανικών και Μηχανικών Υπολογιστών |
| Κύκλος / Επίπεδο | 2ος / Μεταπτυχιακό |
| Περίοδος Διδασκαλίας | Χειμερινή |
| Υπεύθυνος/η | Δημοσθένης Σαρηγιάννης |
| Κοινό | Όχι |
| Κατάσταση | Ενεργό |
| Course ID | 600020741 |
Πρόγραμμα Σπουδών: ΔΠΜΣ ΒΙΟΪΑΤΡΙΚΗ ΜΗΧΑΝΙΚΗ
Εγγεγραμμένοι φοιτητές: 4
| Κατεύθυνση | Τύπος Παρακολούθησης | Εξάμηνο | Έτος | ECTS |
|---|---|---|---|---|
| ΚΟΡΜΟΣ | Υποχρεωτικό | 1 | 1 | 6 |
| Τίτλος | Βιολογία Συστημάτων |
| Ακαδημαϊκό Έτος | 2023 – 2024 |
| Περίοδος Τάξης | Χειμερινή |
| Διδάσκοντες μέλη ΔΕΠ |
|
| Διδάσκοντες άλλων Κατηγοριών | |
| Ώρες Εβδομαδιαία | 4 |
| Class ID | 600244666
|
Τύπος Μαθήματος
Γενικού Υποβάθρου
Τρόπος Παράδοσης
- Πρόσωπο με πρόσωπο
Ηλεκτρονική Διάθεση Μαθήματος
- e-Οδηγός Σπουδών https://qa.auth.gr/el/class/1/600244666
Γλώσσα Διδασκαλίας
- Ελληνικά (Διδασκαλία, Εξέταση)
- Αγγλικά (Διδασκαλία, Εξέταση)
Προαπαιτήσεις
Γενικές Προαπαιτήσεις
Βασικές γνώσεις βιολογίας και μαθηματικών
Μαθησιακά Αποτελέσματα
Κατανόηση βασικών εννοιών της βιολογίας συστημάτων
Βασικές αρχές μαθηματικής μοντελοποίησης βιολογικών συστημάτων
Κατανόηση των μοντέλων κυτταρικών αντιδράσεων
Κατανοηση του τρόπου ρυθμισης των μεταβολικών δικτύων, των ροών μεταβολικών δικτύων και των συστημάτων σηματοδότησης
Κατανόηση βασικών εννοιών των συστημάτων γονιδίων
Γενικές Ικανότητες
- Εφαρμογή της γνώσης στην πράξη
- Αναζήτηση, ανάλυση και σύνθεση δεδομένων και πληροφοριών, με τη χρήση και των απαραίτητων τεχνολογιών
- Λήψη αποφάσεων
- Αυτόνομη εργασία
- Εργασία σε διεθνές περιβάλλον
- Εργασία σε διεπιστημονικό περιβάλλον
- Παραγωγή νέων ερευνητικών ιδεών
Περιεχόμενο Μαθήματος
-Βιολογικά συστήματα / Βιολογικά Συστηματα-Μη Γραμμικά Μαθηματικά
-Εισαγωγή στη μαθηματική μοντελοποίηση
-Στατικά μοντέλα δικτύων
-Τα μαθηματικά των βιολογικών συστημάτων.
-Ανάλυση Ευστάθειας, πορτραιτα φάσης: Εφαρμογή σε πληθυσμιακά μοντέλα και Επιδημιολογία SIRS Model
-Χημική Κινητική (Εισαγωγή σε ιδιόμορφη θεωρία διαταραχών)
-Περιοδική Συμπεριφορά (Περιοδικές τροχιές,Διακλαδώσεις, με εφαρμογή σε Νευρώνες)
-ΜΔΕ και Βιολογία συστημάτων (ΜΔΕ διάχυσης αντίδρασης, Χημοταξης, Σταθερές καταστάσεις σε ΜΔΕ, οδευοντα κύματα - με εφαρμογές σε βιολογικά μοντέλα),
-Μοντέλα κυτταρικών αντιδράσεων
-Εκτίμηση παραμέτρων – Παραμετροποίηση μοντέλων
-Συστήματα γονιδίων
-Άτομο - Πληθυσμός - Είδος
-Γονίδιο - Δομή και ρύθμιση
-Γονιδίωμα - Μεταγράφωμα - Επιγονιδίωμα
-Πολυμορφισμός και Μεταλλάξεις
-Νέες τεχνικές Αλληλούχισης και Παραγωγής DNA Δεδομένων
-Συστήματα πρωτεϊνών
-Μεταβολικά συστήματα
-Δομική ανάλυση μεταβολικών δικτύων Denis
-Δυναμική ανάλυση των ροών μεταβολικών δικτύων Denis
-Συστήματα σηματοδότησης
-Συστήματα πληθυσμών
-Βιολογική ανάλυση πολλαπλών διαστάσεων – ολοκληρωμένη ανάλυση δεδομένων γονιδιακής έκφρασης, ανάλυσης πρωτεϊνών και μεταβολιτών Denis
-Μοντέλα βασισμένα στη φυσιολογία Spyros
-Η συστημική βιολογία στην ιατρική και την ανάπτυξη φαρμάκων
-Η συστημική βιολογία στην εξατομικευμένη πρόληψη
-Νέοι ορίζοντες στη συστημική βιολογία
oΑπό τους νευρώνες στον εγκέφαλο
oΠολύ-βηματικά μοντέλα ανάπτυξης καρκίνου
oΠολυπαραγοντικές ασθένειες, φλεγμονές και τραύμα
oΑλληλεπίδραση περιβάλλοντος και υγείας
Λέξεις Κλειδιά
Βιολογία συστημάτων, μεταβολικές ροές, γονίδια, πληθυσμοί, μαθηματική μοντελοποίηση, κυτταρικές αντιδράσεις, πληθυσμιακά μοντέλα
Τύποι Εκπαιδευτικού Υλικού
- Διαφάνειες
Χρήση Τεχνολογιών Πληροφορίας και Επικοινωνιών
Χρήση Τ.Π.Ε.
- Χρήση Τ.Π.Ε. στη Διδασκαλία
- Χρήση Τ.Π.Ε. στην Εργαστηριακή Εκπαίδευση
- Χρήση Τ.Π.Ε. στην Επικοινωνία με τους φοιτητές
Περιγραφή
Διδασκαλία μαθήματος με χρήση διαφανειών
Εκτέλεση εργαστηρίου με εξειδικευμένο λογισμικό
Επικοινωνία με τους φοιτητές μέσω email
Οργάνωση Μαθήματος
| Δραστηριότητες | Φόρτος Εργασίας | ECTS | Ατομικά | Ομαδικά | Erasmus |
|---|---|---|---|---|---|
| Διαλέξεις | 90 | 3,6 | |||
| Εργαστηριακή Άσκηση | 15 | 0,6 | |||
| Μελέτη και ανάλυση βιβλίων και άρθρων | 15 | 0,6 | |||
| Συγγραφή εργασίας / εργασιών | 15 | 0,6 | |||
| Εξετάσεις | 15 | 0,6 | |||
| Σύνολο | 150 | 6 |
Αξιολόγηση Φοιτητών
Περιγραφή
Εξέταση επί της διδακτέας ύλης
Γραπτή εργασία
Μέθοδοι Αξιολόγησης Φοιτητών
- Γραπτή Εξέταση με Ερωτήσεις Πολλαπλής Επιλογής (Συμπερασματική)
- Γραπτή Εξέταση με Ερωτήσεις Σύντομης Απάντησης (Συμπερασματική)
- Γραπτή Εξέταση με Ερωτήσεις Εκτεταμένης Απάντησης (Συμπερασματική)
- Γραπτή Εργασία (Συμπερασματική)
Βιβλιογραφία
Βιβλιογραφία μαθήματος (Εύδοξος)
Χορεύοντας στο Ρυθμό της Ζωής - Βιολογική Σχετικότητα-Βιολογία Συστημάτων
Κωδικός Βιβλίου στον Εύδοξο: 112691806
Έκδοση: 1/2024
Συγγραφείς: Noble Denis
ISBN: 9789925350872
Τύπος: Σύγγραμμα
Διαθέτης (Εκδότης): BROKEN HILL PUBLISHERS LTD
Εισαγωγή στη Γονιδιωματική
Κωδικός Βιβλίου στον Εύδοξο: 102124945
Έκδοση: 3η αμερικανική-2η ελληνική/2022
Συγγραφείς: Arthur M. Lesk
ISBN: 9786185173777
Τύπος: Σύγγραμμα
Διαθέτης (Εκδότης): UTOPIA ΕΚΔΟΣΕΙΣ Μ. ΕΠΕ.
Εισαγωγή στη Βιοπληροφορική
Κωδικός Βιβλίου στον Εύδοξο: 94702956
Έκδοση: 5η αμερικανική-1η ελληνική/2021
Συγγραφείς: ARTHUR M. LESK
ISBN: 9786185173616
Τύπος: Σύγγραμμα
Διαθέτης (Εκδότης): UTOPIA ΕΚΔΟΣΕΙΣ Μ. ΕΠΕ
Επιπρόσθετη βιβλιογραφία για μελέτη
Systems Biology - The Challenge of Complexity. Shigetada Nakanishi, Ryoichiro Kageyama, Dai Watanabe, Springer Tokyo Berlin Heidelberg New York, ISBN: 978-4-431-87703-5
Τελευταία Επικαιροποίηση
14-02-2024
