Ηλεκτρονική Διάθεση Μαθήματος
Μαθησιακά Αποτελέσματα
Με την επιτυχή ολοκλήρωση του μαθήματος, οι φοιτητές θα γνωρίζουν:
• τους τρόπους εργαστηριακής διάγνωσης ιογενών λοιμώξεων
• τις αρχές μεθόδου PCR, real time PCR, nested PCR, multiplex PCR
• τους τρόπους απομόνωσης ιών σε ζώντα υποστρώματα
• τις αρχές παλαιών και νέων μεθόδων αλληλούχησης και φυλογενετικής ανάλυσης
• τον τρόπο συνδυασμού ποικίλων εργαστηριακών και αναλυτικών δεδομένων για την αξιολόγηση του κάθε περιστατικού
Περιεχόμενο Μαθήματος
• Εργαστηριακή Διάγνωση Ιογενών λοιμώξεων
• Εργαστηριακή Διερεύνηση HIV λοίμωξης
• Ταχείες Διαγνωστικές Μέθοδοι
• Εργαστηριακή Διάγνωση Ιογενών Λοιμώξεων
Μέρος Ι (Το παράδειγμα των ιογενών αναπνευστικών λοιμώξεων )
Αρχή μεθόδου Real-Time PCR, εφαρμογές, αποτελέσματα
• COMBO-Multiplex PCR
• Καλλιέργειες σε εμβρυοφόρα αυγά όρνιθας
• Εργαστηριακή Διάγνωση Ιογενών Λοιμώξεων
Μέρος ΙI (Το παράδειγμα των ιογενών αιμορραγικών πυρετών)
• Περιγραφή περίπτωσης – διαδραστική συζήτηση για επιλογή μεθόδων εργαστηριακής διάγνωσης
• Εργαστηριακή διάγνωση περιστατικού:
Εκχύλιση γενετικού υλικού
Nested PCR- Ηλεκτροφόρηση
Real-Time PCR
• Αλληλούχηση νουκλεοτιδίων κατά Sanger και ανάλυση αλληλουχιών με κατασκευή φυλογενετικού δέντρου
• Τελική αξιολόγηση του περιστατικού
• Κυτταροκαλλιέργειες (Μέρος ΙΙ- Vero 6 cells)
• Next Generation Sequencing - Αρχές μεθόδου-Εφαρμογές
• NGS – MINION (Oxford Nanopore): αξιολόγηση αποτελεσμάτων
Επιπρόσθετη βιβλιογραφία για μελέτη
1.Papa A, Bino S, Llagami A, Brahimaj B, Papadimitriou E, Pavlidou V, Velo E, Cahani G, Hajdini M, Pilaca A, Harxhi A, Antoniadis A. Crimean-Congo hemorrhagic fever in Albania, 2001. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2002 Aug;21(8):603-6. doi: 10.1007/s10096-002-0770-9. Epub 2002 Aug 8. PMID: 12226691.