Το Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών με τίτλο «Χημική Τεχνολογία και Βιομηχανικές Εφαρμογές» του Τμήματος Χημείας προσφέρει υψηλού επιπέδου μεταπτυχιακή εκπαίδευση, στις εξής τρεις ειδικεύσεις: Ειδίκευση Α «Χημική και Περιβαλλοντική Τεχνολογία». Ειδίκευση Β «Χημεία και Τεχνολογία Πολυμερών και Νανοσύνθετων Υλικών». Ειδίκευση Γ «Χημεία, Τεχνολογία και Έλεγχος Τροφίμων και Ζωοτροφών».
Εκπαιδευτικό αντικείμενο του ΠΜΣ «Χημική Τεχνολογία και Βιομηχανικές Εφαρμογές» είναι η θεωρητική και πρακτική κατάρτιση των φοιτητών σε θέματα της ειδίκευσης τους και η εισαγωγή στην έρευνα. Τα δύο πρώτα εξάμηνα οι φοιτητές υποχρεούνται να παρακολουθήσουν και να εξεταστούν με επιτυχία σε μαθήματα τα οποία πιστώνονται με 60 ΕCTS συνολικά. Στο τρίτο εξάμηνο οι φοιτητές εκπονούν Μεταπτυχιακή Διπλωματική Εργασία ερευνητικού χαρακτήρα η οποία πιστώνεται με 30 ΕCTS. Συνολικά απαιτείται η συμπλήρωση 90 ΕCTS και ελάχιστη διάρκεια φοίτησης είναι 3 εξάμηνα.
Σκοπός του ΠΜΣ είναι η προαγωγή της γνώσης, η εκπαίδευση και προετοιμασία εξειδικευμένου επιστημονικού δυναμικού για στελέχωση τόσο της έρευνας όσο και της παραγωγής, με απώτερο στόχο την ικανοποίηση των εκπαιδευτικών, ερευνητικών, κοινωνικών, πολιτιστικών και αναπτυξιακών αναγκών της χώρας. Ειδικότερα στοχεύει στην υψηλού επιπέδου κατάρτιση και εξειδίκευση επιστημόνων στους τομείς της Χημικής και Περιβαλλοντικής Τεχνολογίας, της Χημείας και Τεχνολογίας Πολυμερών και Νανοσύνθετων Υλικών, και της Χημείας, Τεχνολογίας και Ελέγχου Τροφίμων και Ζωοτροφών.
Επιπλέον των βασικών γνώσεων στην ειδίκευση τους, οι απόφοιτοι αποκτούν ικανότητα κριτικής και αυτοκριτικής, την ικανότητα να αναζητούν, να αναλύουν και να συνθέτουν δεδομένα και πληροφορίες, να εργάζονται αυτόνομα ή σε ομάδες, να παράγουν νέες ιδέες, να προάγουν την ελεύθερη παραγωγική και επαγωγική σκέψη.