BIOINFORMATICS
| Titre | ΒΙΟΠΛΗΡΟΦΟΡΙΚΗ / BIOINFORMATICS |
| Code | GM.MGB.6.7 |
| Cycle / Niveau | 1er cycle / Licence |
| Semestre de l’année | Spring |
| Coordinator | Ilias Kappas |
| Common | Non |
| Statut | Actif |
| Course ID | 40001171 |
Programme d' Études: PPS Tmīma Viologías (2017-sīmera)
Registered students: 119
| Orientation | Attendance Type | Semester | Année | ECTS |
|---|---|---|---|---|
| Moriakī Viología, Genetikī kai Viotechnología | EPILOGĪS A | 6 | 3 | 6 |
| Perivallontikī Viología | EPILOGĪS | 6 | 3 | 6 |
| Genikī | EPILOGĪS | 6 | 3 | 6 |
| Année Académique | 2020 – 2021 |
| Semestre de l’Année | Spring |
| Faculty Instructors | |
| Weekly Hours | 3 |
| Class ID | 600167955
|
Class Schedule
| Building | Βιολογίας |
| Floor | Ισόγειο |
| Hall | ΑΙΘΟΥΣΑ Ι1 "ΜΠΑΜΠΑΛΩΝΑΣ ΔΗΜΗΤΡΙΟΣ" (207) |
| Calendrier | Τετάρτη 17:00 έως 19:00 |
Course Type 2016-2020
- Domaine Scientifique
- Développement de Compétences
Mode d’Enseignement
- En présentiel
Accès en Ligne
- e-Study Guide https://qa.auth.gr/fr/class/1/600167955
- Site web du Département : http://www.bio.auth.gr/course/viopliroforiki
- eLearning (Moodle):
Language of Instruction
- Grec (Enseignement, Examens)
- Anglais (Enseignement, Examens)
Aptitudes Générales
- Application des connaissances à la pratique
- Recherche, analyse et synthèse de données et d’informations, avec utilisation des technologies adéquates
- Travail en autonomie
- Travail d’équipe
- Travail en environnement international
- Travail en environnement pluridisciplinaire
- Production de nouvelles idées de recherche
Type de Matériels Éducatifs
- Vidéoconférences
- Exercices interactifs
- Livre
Use of Information and Communication Technologies
Use of ICT
- Emploi de TIC pour l’enseignement
- Emploi de TIC pour les activités de laboratoire
- Emploi de TIC pour communiquer avec les étudiants
- Emploi de TIC pour l’évaluation des étudiants
Organisation du Cours
| Activités | Charge de travail | ECTS | Individuel | En groupe | Erasmus |
|---|---|---|---|---|---|
| Conferences | 30 | 1.2 | ✓ | ||
| Seminaires | 2 | 0.1 | ✓ | ||
| Laboratoires | 20 | 0.8 | ✓ | ||
| Etude & analyse bibliographiques | 60 | 2.4 | |||
| Mise a niveau | 2 | 0.1 | ✓ | ||
| Enseignement interactif sur ordinateur | 12 | 0.5 | ✓ | ||
| Examens | 24 | 1.0 | |||
| Total | 150 | 6 |
Student Assessment
Student Assessment methods
- Examen écrit : questionnaire à choix multiples (Sommative)
- Examen écrit : réponses courtes (Sommative)
- Examen écrit : réponses plus longues (Sommative)
- Examen écrit : résolution de problèmes (Formative, Sommative)
Bibliography
Course Bibliography (Eudoxus)
Βιοπληροφορική & Λειτουργική Γονιδιωματική, Jonathan Pevsner. Ακαδημαϊκές Εκδόσεις Ι. Μπάσδρα & ΣΙΑ Ο.Ε., Έκδοση 3η.
Additional bibliography for study
β1. Νικολάου Χ. 2016. Υπολογιστική Βιολογία. Ελληνικά Ακαδημαϊκά Ηλεκτρονικά Συγγράμματα και Βοηθήματα (www.kallipos.gr).
β2. Ηλεκτρονικό υλικό στο Blackboard
β3. Χρήσιμες ιστοσελίδες
- National Center for Biotechnology Information (NCBI)
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
- European Bioinformatics Institute (EBI)
http://www.ebi.ac.uk/
- Ensembl Genome Browser
http://www.ensembl.org/index.html
- PubMed
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed
- Bionformatics (Oxford Journals)
http://bioinformatics.oxfordjournals.org/
- Nucleic Acids Research (Oxford Journals)
http://nar.oxfordjournals.org/
- Sequence Retrieval System (SRS)
http://srs.ebi.ac.uk/srsbin/cgi-bin/wgetz?-page+srsq2+-noSession
- Codon Usage Database
http://www.kazusa.or.jp/codon/
- The Restriction Enzyme Database (REBASE)
http://rebase.neb.com/rebase/rebase.html
- Genomatix Software Suite
http://www.genomatix.de/cgi-bin/tools/tools.pl
- Bioweb (Institut Pasteur)
http://bioweb2.pasteur.fr/
- The GENSCAN Web Server at MIT
http://genes.mit.edu/GENSCAN.html
- Softberry
http://linux1.softberry.com/berry.phtml
- Phylogeny Programs
http://evolution.genetics.washington.edu/phylip/software.html
Last Update
25-08-2021
