Βιοανάλυση και τεχνολογίες -omics

Πληροφορίες Μαθήματος
ΤίτλοςΒιοανάλυση και τεχνολογίες -omics / Bioanalysis and -OMICS
ΚωδικόςΒΤ3
ΣχολήΠολυτεχνική
ΤμήμαΧημικών Μηχανικών
Κύκλος / Επίπεδο2ος / Μεταπτυχιακό
Περίοδος ΔιδασκαλίαςΧειμερινή/Εαρινή
Υπεύθυνος/ηΧριστίνα Βιργιλίου
ΚοινόΌχι
ΚατάστασηΕνεργό
Course ID600023202

Πρόγραμμα Σπουδών: ΠΜΣ Χημική και Βιοχημική Μηχανική: Υγεία & Τρόφιμα

Εγγεγραμμένοι φοιτητές: 0
ΚατεύθυνσηΤύπος ΠαρακολούθησηςΕξάμηνοΈτοςECTS
ΚΟΡΜΟΣΥποχρεωτικό327,5

Πληροφορίες Τάξης
ΤίτλοςΒιοανάλυση και τεχνολογίες -omics
Ακαδημαϊκό Έτος2025 – 2026
Περίοδος ΤάξηςΧειμερινή
Διδάσκοντες μέλη ΔΕΠ
Class ID
600245486
Τύπος Μαθήματος
Ειδικού Υποβάθρου
Τρόπος Παράδοσης
  • Πρόσωπο με πρόσωπο
Ηλεκτρονική Διάθεση Μαθήματος
Γλώσσα Διδασκαλίας
  • Ελληνικά (Διδασκαλία, Εξέταση)
  • Αγγλικά (Διδασκαλία, Εξέταση)
Μαθησιακά Αποτελέσματα
Μέσω της διδασκαλίας του εν λόγω μαθήματος, οι φοιτητές εξοικειώνονται με τις βασικές αρχές της Βιοαναλυτικής Χημείας και των εφαρμογών της, των τεχνικών επεξεργασίας των διάφορων βιολογικών δειγμάτων, αλλά και την επιλογή της κατάλληλης αναλυτικής τεχνολογίας. Οι φοιτητές μετά την ολοκλήρωση των παραδόσεων θα: • Αποκτήσουν κριτική ικανότητα για την ανάπτυξη βιοαναλυτικών μεθόδων για τον προσδιορισμό μιας συγκεκριμένης ένωσης από μια συγκεκριμένη βιολογική μήτρα. • Μπορούν να εφαρμόσουν τη θεωρητική αποκτηθείσα γνώση στη πράξη. • Έχουν κατανοήσει τις βασικές αρχές των αναλυτικών τεχνικών, και στη συνέχεια θα είναι σε θέση να συγκρίνουν τις διαφορετικές ενόργανες προσεγγίσεις για την επιλογή της καταλληλότερης μεθόδου για την ανάλυση ενός συγκεκριμένου αναλύτη. • Είναι σε θέση να εφαρμόζουν βασική χημειομετρία - στατιστική. • Μπορούν να περιγράψουν βασικές τεχνικές προκατεργασίας ενός βιολογικού δείγματος. • Γνωρίζουν τι είναι η Βιολογία Συστημάτων. • Γνωρίζουν τα κύρια βήματα επικύρωσης μια αναλυτικής μεθόδου σε συμμόρφωση με τις οδηγίες των ελεγκτικών οργανισμών. • Γνωρίζουν τις βασικές αρχές των φαρμακοκινητικών μελετών και της ανάπτυξης νέων φαρμάκων. • Γνωρίζουν τις βασικές αρχές λειτουργίας διαφόρων αναλυτικών τεχνολογιών. • Συμμετέχουν σε δραστηριότητες οι οποίες προάγουν τη συνεργασία και οδηγούν σε επαγγελματική πρόοδο και προσωπική ανάπτυξη.
Γενικές Ικανότητες
  • Εφαρμογή της γνώσης στην πράξη
  • Λήψη αποφάσεων
  • Ομαδική εργασία
Περιεχόμενο Μαθήματος
Περιεχόμενο Μαθημάτων - Εισαγωγή στη Βιοανάλυση. - Ολιστική ανάλυση. Τεχνικές omics. - Επεξεργασία δεδομένων και στατιστική ανάλυση. - Περιγραφή βιολογικών υποστρωμάτων. - Τεχνικές προκατεργασίας βιολογικών δειγμάτων. - Μεταλλομική και εφαρμογές. - Σύγχρονές αναλυτικές τεχνικές στη Βιοανάλυση και εφαρμογές. - Επικύρωση αναλυτικών/βιοαναλυτικών μεθόδων. Εργαστηριακές Ασκήσεις 1η Εργαστηριακή Άσκηση. Επίδειξη ενός τυπικού workflow μεταβολομικής ανάλυσης με LC-MS. 2η Εργαστηριακή Άσκηση. Ανάλυση αντιβιοτικού σε δείγματα αίματος που λήφθηκαν σε διαφορετικές χρονικές στιγμές με LC-MS (υπάρχουν διαθέσιμα στο εργαστήριο). 3η Εργαστηριακή Άσκηση. Προκατεργασία διαφόρων υποστρωμάτων, όπως αίμα, ούρα, DBS και DUS για ανάλυση με LC-UV και GC-MS . 4η Εργαστηριακή Άσκηση. Προκατεργασία και ανάλυση ούρων για τον προσδιορισμό χαλκού με FAAS. 5η Εργαστηριακή Άσκηση. Προκατεργασία και ανάλυση βιολογικών υποστρωμάτων για τον προσδιορισμό φαρμάκων και ναρκωτικών με LC-qTOF και GC-MS/MS.
Τύποι Εκπαιδευτικού Υλικού
  • Σημειώσεις
  • Διαφάνειες
  • Διαδραστικές ασκήσεις
  • Βιβλίο
Χρήση Τεχνολογιών Πληροφορίας και Επικοινωνιών
Χρήση Τ.Π.Ε.
  • Χρήση Τ.Π.Ε. στη Διδασκαλία
  • Χρήση Τ.Π.Ε. στην Εργαστηριακή Εκπαίδευση
  • Χρήση Τ.Π.Ε. στην Επικοινωνία με τους φοιτητές
Οργάνωση Μαθήματος
ΔραστηριότητεςΦόρτος ΕργασίαςECTSΑτομικάΟμαδικάErasmus
Διαλέξεις240,8
Εργαστηριακή Άσκηση150,5
Μελέτη και ανάλυση βιβλίων και άρθρων1836,1
Εξετάσεις30,1
Σύνολο2257,5
Αξιολόγηση Φοιτητών
Μέθοδοι Αξιολόγησης Φοιτητών
  • Γραπτή Εξέταση με Ερωτήσεις Πολλαπλής Επιλογής (Συμπερασματική)
  • Γραπτή Εξέταση με Ερωτήσεις Σύντομης Απάντησης (Συμπερασματική)
  • Γραπτή Εξέταση με Ερωτήσεις Εκτεταμένης Απάντησης (Συμπερασματική)
  • Γραπτή Εργασία (Συμπερασματική)
  • Δημόσια Παρουσίαση (Συμπερασματική)
Βιβλιογραφία
Βιβλιογραφία μαθήματος (Εύδοξος)
Βιοαναλυτική Χημεία (2015), Γ. Θεοδωρίδης, Σ. Γηρούση, Γ. Ζαχαριάδης, Α. Ζώτου, Β. Σαμανίδου, Ελληνικά Ακαδημαϊκά Ηλεκτρονικά Συγγράμματα και Βοηθήματα, www.kallipos.gr .
Επιπρόσθετη βιβλιογραφία για μελέτη
1. Bioanalytical Chemistry, Mikkelsen and Corton, 2nd edition, Wiley, 2016. 2. FDA Bioanalytical Method Validation Guidelines: https://www.fda.gov/regulatory-information/search-fda-guidance-documents/bioanalyticalmethod-validation-guidance-industry. 3. Handbook of LC-MS Bioanalysis: Best Practices, Experimental Protocols, and Regulations, Wenkui Li PhD, Jie Zhang PhD, Francis L.S. Tse PhD. 4. Bioanalysis of Pharmaceuticals: Sample Preparation, Separation Techniques, and Mass Spectrometry, Steen Honoré Hansen, Stig Pedersen-Bjergaard. 5. The Handbook of Metabonomics and Metabolomics (2007), John C. Lindon, Jeremy K. Nicholson and Elaine Holmes. 6. Best Practice in Biological Sample Collection, Processing, and Storage for LC-MS in Bioanalysis of Drugs, Maria Pawula, Glen Hawthorne, Graeme T. Smith, Howard M. Hill. 7. Best Practices in LC-MS Method Development and Validation for Dried Blood Spots, Chapter 30, Jie Zhang, Tapan K. Majumdar, Jimmy Flarakos, Francis L.S. Tse. 8. Quantitative determination of endogenous compounds in biological samples using chromatographic techniques, Nico C.van de Merbel. 9. Glucose biosensors: an overview of use in clinical practice, Eun-Hyung Yoo, Soo-Youn Lee. 10. Metallomics: the concept and methodology, Sandra Mounicou, Joanna Szpunara and Ryszard Lobinski.
Τελευταία Επικαιροποίηση
20-02-2024