Ηλεκτρονική Διάθεση Μαθήματος
Μαθησιακά Αποτελέσματα
Με την επιτυχή ολοκλήρωση του μαθήματος, οι φοιτητές θα:
1) εξοικειωθούν με τις βασικές αρχές σχεδιασμού, δομής και οργάνωσης βιολογικών βάσεων δεδομένων
2) μπορούν να ανακτούν και να αναλύουν διαθέσιμα δεδομένα
3) κατανοούν το περιεχόμενο των GenBank flatfiles
4) μπορούν να διεξάγουν στοίχιση ακολουθιών DNA
5) μπορούν να διεξάγουν αναζητήσεις BLAST
6) μπορούν να ανακτούν δεδομένα μέσω πρόσβασης API.
Περιεχόμενο Μαθήματος
Τα περιεχόμενα του μαθήματος περιλαμβάνουν: 1) βασικές αρχές σχεδιασμού, δομής και οργάνωσης βιολογικών βάσεων δεδομένων, 2) ανάκτηση και ανάλυση της διαθέσιμης πληροφορίας, 3) ανάλυση περιεχομένου GenBank flatfiles, 4) στοίχιση ακολουθιών DNA, 5) ο αλγόριθμος BLAST, 6) πρόσβαση API και ανάκτηση δεδομένων σε βιολογικές βάσεις δεδομένων, 7) βάσεις δεδομένων βιοϊατρικής και καρκίνου.