Ηλεκτρονική Διάθεση Μαθήματος
Μαθησιακά Αποτελέσματα
Με την επιτυχή ολοκλήρωση του μαθήματος, οι φοιτητές θα:
1) μπορούν να σχεδιάζουν πειράματα για μελέτες πληθυσμιακής γονιδιωματικής
2) αναγνωρίζουν και θα κατηγοριοποιούν δεδομένα γενετικών πολυμορφισμών από μεγάλο εύρος δεδομένων
3) επεξεργάζονται και θα αναλύουν δεδομένα πολλαπλών γονιδιωμάτων
4) υπολογίζουν και θα ερμηνεύουν δείκτες πληθυσμιακής γενετικής
5) εφαρμόζουν μεθόδους στατιστικής επεξεργασίας και απεικόνισης των αποτελεσμάτων
6) εντοπίζουν τους πολυμορφισμούς που βρίσκονται υπό επιλογή
7) προσδιορίζουν δείκτες πληθυσμιακής δημογραφίας.
Περιεχόμενο Μαθήματος
Τα περιεχόμενα του μαθήματος περιλαμβάνουν: 1) τον πειραματικό σχεδιασμό και πειραματικές προσεγγίσεις στην πληθυσμιακή γονιδιωματική (π.χ. ddRAD, poolseq), 2) το φιλτράρισμα δεδομένων και την αναγνώριση γενετικών πολυμορφισμών σε διάφορα είδη δεδομένων (π.χ. ddRAD, δεδομένα μεταγραφωμάτων), 3) την επεξεργασία και ανάλυση πολλαπλών γονιδιωμάτων, 4) τον υπολογισμό και ερμηνεία δεικτών πληθυσμιακής γενετικής από χιλιάδες γενετικούς τόπους, 5) την παρουσίαση μεθόδων στατιστικής επεξεργασίας και απεικόνισης αποτελεσμάτων, 6) παρουσίαση μεθόδων ανίχνευσης πολυμορφισμών υπό επιλογή (π.χ. GWAS, genome scans), 7) τον προσδιορισμό ιστορικής πληθυσμιακής δημογραφίας.